Kiedy mieszkańcy Gotham City zasypują telefonami o inwazji Marsjan komisarza Gordona, ten ma już powoli tego dość. Sytuacja jednak się zmienia kiedy w bibliotece jego córka Barbara osobiście dostrzega zielonego Marsjanina. Po tych informacjach Dynamic Duo nie mają już wątpliwości, że coś złego dzieje się w Gotham City, dlatego z biura komisarza Gordona od razu wracają do jaskini. Nie wiedzą jednak, że Verdigris, jeden z ludzi Jokera, który przebrany za Marsjanina wywołuje panikę u Gothamczyków, umieścił Batmobilu bombę, która ma wybuchnąć o północy.

Tymczasem w swojej kryjówce Joker już się przygotowuje do zbudowania własnego latającego spodku, na podstawie planów szalonego naukowca z którym dzielił celę, by w ten sposób przejąć władzę nad światem.

Dzięki wykorzystaniu Current Criminal Activity Batdisclosure Unit Dynamic Duo dowiadują się, że to Joker za wszystkim stoi i że planuje zbudować własny latający spodek. Batman domyśla się, że złoczyńca będzie chciał wykorzystać lekki metal, taki jak beyllium, który obecnie przechowywany jest w Wayne Foundation Metal Research Wing. Bruce najpierw wysyła na miejsce Alfreda i zawiadamia też o wszystkim komisarza Gordona, skąd też o planie Batmana dowiaduje się Barbara, która postanawia wesprzeć Dynamic Duo.

Wybuch bomby o północy psuje jednak wszystkie plany. Ludzie Jokera bez problemów łapią Batgirl i Alfreda, którego złoczyńca uznaje za szalonego naukowca. Dopiero po 8 godzinach Dynamic Duo odzyskują przytomność. Udało im się przeżyć tylko dzięki Anti-Thermal Bat-T-Shirts, które ochroniły ich przed wybuchem. Niestety większość sprzętu w jaskini została zniszczona, w tym te służące do komunikacji. Zaniepokojoni niemożliwością skontaktowania się z Batmanem są także komisarz Gordon i burmistrz Linseed. Po uruchomieniu Auxiliary Circuit Bat-Regenerator Batmanowi udaje się przywrócić zasilanie w jaskini i nawiązać kontakt z Alfredem, który informuje go o tym, że latający spodek Jokera został już ukończony. Złoczyńca planuje też wysłać przyczepioną do rakiety Batgirl, ale po aktywowaniu przez Barbarę Automatic Fuse Extinguisher, nie ma szans by udało się odpalić rakietę. Z tego powodu złoczyńca zmuszony jest zabrać bohaterkę na pokład swojego latającego spodku, by podbić inne galaktyki.

Pod dotarciu za pomocą Batcycle'a i Sidecara do Batcoptera Batman i Robin rozpoczynają poszukiwania złoczyńcy. Dzięki informacjom od Alfreda, który zadbał o to by spodek Jokera powrócił do The Abandoned Launching Pad Factory, wiedzą gdzie mają się udać. Tuż po wylądowaniu Batman i Robin atakują niczego niespodziewającego się łotra i jego pomocników. Po walce policja zabiera Jokera tam gdzie jego miejsce, do więzienia.

Tymczasem w Gotham City zjawiają się Cassandra Spellcraft, alias dr Cassandra i jej mąż Cabala, którzy kradną cenny diament ze sklepu Spiffany'ego.